微滤、超滤、纳滤、反渗透和电渗析都属于膜分离范畴。由于中草药有效成分的分子量小于1000，无效成分的分子量为几万至几十万，因此非常适合于超滤膜分离纯化中药，也适用于采用纳滤技术浓缩中药，达到节能、提高产品质量的目的。
采用超滤技术可以滤除中药水提液或醇提液中相对分子质量大于几万的无效成份，如纤维素、黏液质、树胶、淀粉、鞣质、蛋白质（少数药材除外）、树脂等，比如采用超滤提取中药有效部位和有效成份，如黄芩甘、六味地黄活性多糖、侧柏叶总黄酮等。超滤技术还广泛应用于中药注射液的制备，如采用两步超滤膜制备伸筋草注射液，采用截留分子量为1万~3万超滤膜驱除大分子物质，采用截留分子量6000的超滤膜除去小分子杂质及制备过程中加入的氯化钠。制备得到的注射液，受率高、澄清度好，氯化钠含量从5%下降到1%，流程简单，易批量生产。在中药口服液制备中超滤技术也得到广泛应用，如在生脉饮口服液生产中，超滤法同水提醇沉法相比总固体提高51.83%；总黄酮提高23.40%，总多糖提高90.08%；总有机酸提高8.03%；色泽由棕色变为浅棕色，原工艺（水提醇沉法）生产的生脉饮口服液贮存6个月即产生沉淀，而新工艺（超滤法）生产的生脉饮口服液放置18个月后仍澄清透明。原生产工艺中需大量使用酒精，而且在用专用设备回收酒精时，不但设备投资大，而且酒精耗损量在30%以上，严重污染了环境，而新工艺不存在这些弊端。
由于中药的有效成份分子量一般为1000以下，比较适合用纳滤浓缩。中药的传统浓缩方法，如多效蒸馏有很多的弊端，存在能耗高，有机溶剂损耗严重，对水资源和大气污染严重，有效成份损失高的缺点。纳滤应用于中药的浓缩和分离则有效地解决了以上的问题。由于纳滤膜运行于常温无相变，对于中药中一些热敏性药物如皂甙、甾类、萜类等的分离和浓缩更为合适。
采用纳滤膜分离技术用于云南白药皂甙的醇提液浓缩分离，可将纳滤的透过液（酒精）直接回用于生产工艺，由于膜分离系统可实现封闭循环，乙醇损耗大大减少。蒸汽、真空消耗量也减少，生产工艺简化，人员节省，生产周期缩短，产品质量稳定并提高；采用纳滤膜分离技术用于中药水提液浓缩分离，蒸汽耗量减少，生产周期大大缩短，人员节省，透过液（水）可考虑回用于生产工艺中，产品的质量将更稳定和改善。经初步估算，一年内酒精损耗减少这一项的费用可将设备的投资成本收回。目前该系统运行参数比较稳定，初步满足设计要求。在银杏黄酮、葛根素等中药的生产过程中，也成功地采用纳滤来预浓缩，对料液浓缩20倍以上，再进入负压三效浓缩，实现节能80%以上，同时回收酒精，实现清洁生产。
